软件列表
(1)生物信息学数据库及相应的数据分析平台
(2)生物大分子检索系统
(3)鱼类检索系统
软件简介
1、生物信息学数据库及相应的数据分析平台
生物信息学数据库是指存储生物学和生物信息学数据的计算机化系统。这些数据库包含了各种生物学数据,如基因组序列、蛋白质序列、代谢通路、基因表达数据、蛋白质结构、生物图像等。这些数据库为生物学家和生物信息学家提供了宝贵的研究资源。
建设1个物种的生物信息学数据库及相应的数据分析平台。平台建于现有服务器上,以网站形式提供数据存储与数据分析服务。网站首页包括菜单栏、种质资源分布、新闻、相关网站及工具链接四部分。
2、生物大分子检索系统
生物大分子检索系统软件主要用于将输入的核酸或蛋白质序列与数据库中的已知序列进行比对,从而获取序列相似度等信息,帮助判断序列的来源或进化关系。
建立生物分子数据库,整理收集生物类各专业大学本科阶段相关课程中的生物分子结构数据,通过多种查询方式,调用数据库信息,对分子的空间结构进行全方位展示,通过对分子的结构信息进行测量和预测,实现微观分子可视化,使学生可以形象、直观地认知生物分子结构,探究分子的结构和功能的关系。
(1)多种查询方式并存的搜索平台构建
(2)内容查询法:采用级联菜单模式,根据课程的内容,即生物分子在课程中的出现顺序进行搜寻
(3)名称查询法:根据生物分子的中英文名称、学名或缩写进行查询
(4)功能查询法:根据生物分子的功能进行分类查询
(5)结构查询法:根据生物分子的结构进行分类查询
(6)数据库的构建和调用:蛋白质、DNA、RNA及其复合物结构数据库的查询和调用,数据文件采用pdb和mol2格式存储
3、鱼类检索系统
主要包括五部分:数据库简介、鱼类数据库、鉴赏库、类别库、注释/知识点链接库。
(1)数据库简介:对主页的数据库名称和简介进行编辑
(2)鱼类数据库:主要用来保存鱼的具体信息,可进行增加、删减、编辑
(3)鉴赏库:主要对鱼类鉴赏模块进行增加、编辑、删除
(4)类别库:主要对鱼类的目、科进行增加、编辑、删除
(5)注释/知识点链接库:增加、编辑、删除知识链接库信息
